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軟件介紹
Beacon Designer官方版是一款非常受歡迎的引物設(shè)計(jì)輔助軟件。Beacon Designer最新版支持使用基因突變的序列加載到實(shí)驗(yàn)上分析,支持使用DNA引物分析查看實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的變化。Beacon Designer官方版支持在生物分析上擴(kuò)展數(shù)據(jù)的變化以及外部分子,支持建立多種基因的序列分析,支持生物鏈的制作以及基因模型制作。
基本簡(jiǎn)介
Beacon Designer官方版是一款專為生物實(shí)驗(yàn)相關(guān)行業(yè)所打造的設(shè)計(jì)工具。軟件能夠結(jié)合一些化學(xué)的公式使用,您可以在分析生物數(shù)據(jù)的時(shí)候加載一些化學(xué)的公式到軟件上標(biāo)注,軟件還能夠?qū)⒎治龅纳飻?shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為基因模型的方式查看。
功能介紹
SYBR? Green 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
SYBR? Green 可能是實(shí)時(shí)PCR中最常用的化學(xué)分子。BeaconDesigner?可以設(shè)計(jì)SYBR? Green PCR引物,并且可以幫助您進(jìn)行前導(dǎo)引物評(píng)估。您可以自主控制設(shè)計(jì)參數(shù)或者直接選擇由專家研究和交流后得到的默認(rèn)值。同時(shí)您還可以針對(duì)特殊的實(shí)驗(yàn)需要自己設(shè)置默認(rèn)值。除了可以在目的基因的任意位置中定位引物,Beacon Designer 還可以跨內(nèi)顯子-內(nèi)顯子或外顯子-外顯子設(shè)計(jì)引物。跨外顯子內(nèi)含子連接的引物設(shè)計(jì)有助于選擇性地從gDNA中擴(kuò)增得到cDNA。
HRMA 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
Beacon Designer官方版提供了一個(gè)檢測(cè)突變的高效方法。相對(duì)于以探針為基礎(chǔ)的基因型分析,HRMA更經(jīng)濟(jì)實(shí)惠。該軟件運(yùn)用一種特有的專利的算法,能夠設(shè)計(jì)出檢測(cè)突變的最好引物。
HRMA引物被設(shè)計(jì)將感興趣的突變?cè)O(shè)計(jì)于最短的擴(kuò)增子,能夠檢測(cè)到解鏈溫度變化。引物避免了模板的二級(jí)結(jié)構(gòu),保證了有效的引物延伸。HRMA引物可以在NCBI上比對(duì)核苷酸信息來檢測(cè)特異性。此外,預(yù)引物和已經(jīng)發(fā)表的引物同樣可以用來檢測(cè)。
雙標(biāo)簽探針設(shè)計(jì)
Beacon Designer官方版目前支持基于四種探針的化學(xué)反應(yīng):
TaqMan 探針
使用Beacon Designe能夠幫助您研究不同基因表達(dá)以及單核苷酸多態(tài)性。同樣,您可以選擇LNA替代taqman探針,它比taqman探針更加穩(wěn)定。Beacon Designer?可以幫助您設(shè)計(jì)甲基化的taqman探針。MethyLight 是一個(gè)高通量的分析,用來區(qū)別甲基化和非甲基化的DNA。通過Beacon D
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